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源于1921年成立的东南大学农产制造门和1927年创办的中央大学农产制造门、食品工业系。1985年，学校在全国农业院校中率先成立了食品科学系。1996年成立万博体育
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学院拥有博士学位一级授予权，博士后流动站，国家重点（培育）学科，江苏省一级学科重点学科，江苏省优势学科，1个博士点，1个硕士点，2个专业学位授权点。设有食品科学与工程、食品质量与安全、生物工程和食品营养与健康4个本科专业，其中前三个专业入选国家一流专业建设点和江苏省品牌专业。食品科学学科在全国第四轮和第五轮评估中获评A类，为学校“农业科学”学科进入全球前1‰作出重要贡献。
学院现有教职工119人，专任教师78人，其中教授31人，副教授32人，专任教师96%拥有博士学位，其中3人获国家级人才称号，1人入选国际食品科学院、美国IFT Fellow及国际标准化组织“肉禽鱼蛋及其制品委员会”（ISO/TC34/SC6）主席，省部级人才40多人次，30余人任职于全国学术性团体或担任国际学术期刊编委。
学院历经近40年的发展，现已形成以肉品加工与质量控制为优势，以食品微生物与生物技术、农产品加工与质量控制、食品营养与健康、糖组学与糖生物工程为特色的五个研究方向。学院拥有“肉品质量控制与新资源创制”全国重点实验室及其他部省级教学科研平台13个，国家一级学会“中国畜产品加工研究会”挂靠学院。近五年来，学院承担国家、部省级科研项目329项，科研到位经费2.43亿元，在国内外学术期刊上发表论文1674篇，其中SCI收录1148篇，申请专利166项，授权专利130项，制定国际、国家标准25项，获国家科技进步二等奖1项，其他部省级、行业科技进步奖23项，出版专著10余部，教材20余部。
学院先后与加州大学戴维斯分校、康奈尔大学、雷丁大学、密歇根州立大学等海外知名大学建立了稳定的国际交流与合作关系。与温氏集团、桂柳集团、雨润集团、江苏省食品集团有限公司、中粮集团等一大批龙头企业开展深度合作，足迹遍布全国各地，产生了显著的经济和社会效益。
学院始终坚持以科技创新促进产业升级、造福亿万百姓，积极构建全球范围内的交流与合作，以推动中国食品产业发展和服务公众营养健康为己任，致力于人才培养、科技创新和社会服务。
食品科学与工程专业介绍
南京农业大学食品科学与工程专业成立于1985年并于当年招生，2003年被遴选为江苏省特色专业建设点，2006年被评为江苏省品牌专业，2009年获批国家级特色专业，2012年获批江苏省重点专业，2013年被列入江苏省重点专业立项建设，2014年入选教育部首批“复合应用型”卓越农林人才教育培养计划改革试点项目，2018年和2020年先后入选教育部首批和第二批“新工科”研究与实践项目，2019年，先后通过教育部工程教育专业认证和美国食品科学技术学会IFT(the Institute of Food Technologists)专业认证，同年入选国家一流专业建设点，2020年获批江苏省品牌专业，2022年获批江苏省产教融合型品牌专业。
食品质量与安全专业介绍
食品质量与安全专业2002年获批，2003年开始招生，为国内开设该专业的最早高校之一，每届平均招生60人，学制4年，授予工科学位，学生在卫岗校区学习。本专业2009年被评为校级特色专业，2010年被遴选为江苏省级特色专业，2012年获批江苏省“食品科学与工程类”重点专业，2017年开始大类招生，分流培养，2020年本专业入选国家一流专业建设点，2021年获批江苏省品牌专业，2023年入选江苏省卓越工程师教育培养计划 2.0专业。
生物工程专业介绍
本专业于2000年正式招生，2009年获批为江苏省特色专业，2022年入选国家一流专业建设点和江苏省品牌专业。本专业以南京农业大学万博体育
食品科学与工程专业为起点，以我校生物学科强大的科研背景为依托，拥有本、硕、博三个层次的完整培养体系，专业教育以微生物发酵、酶工程和食品生物技术为特色，兼顾医药生物技术、环境生物技术和海洋生物技术等，旨在培养基础扎实、知识面宽的生物技术产品的研究、开发、生产等方面的高层次人才。
食品营养与健康专业介绍
食品营养与健康专业于2022年成立并招生。本专业围绕国家经济社会和大健康产业发展需求，坚持“德育为先、能力为重、全面发展”的育人理念，按照“大健康”理念，依托我校深厚的食品原料生产学科基础和优质教学资源，以及食品科学国家重点（培育）学科完善的本、硕、博人才培养体系，培养具有人文素养、家国情怀、全面发展、德才兼备，具备解决营养食品开发、功能评价和健康管理等相关问题的能力，能够胜任食品营养与健康领域相关技术和管理工作的创新性人才。
